BAKTERI BACILLUS SUBTILIS

Bacillus subtilis merupakan bakteri gram-positif yang berbentuk batang,dan secara alami sering ditemukan di tanah dan vegetasi. Bacillus subtilis juga telah berevolusi sehingga dapat hidup walaupun di bawah kondisi keras dan lebih cepat mendapatkan perlindungan terhadap stres situasi seperti kondisi pH rendah (asam), bersifat alkali, osmosa, atau oxidative kondisi, dan panas atau etanol Bakteri ini hanya memilikin satu molekul DNA yang berisi seperangkat set kromosom. DNAnya berukuran BP 4214814 (4,2 Mbp) (TIGR CMR). 4,100 kode gen protein. Beberapa keunggulan dari bakteri ini adalah mampu mensekresikan antibiotik dalam jumlah besar ke luar dari sel (Scetzer, 2006).

Gambar 1. Bacillus Subtilis

Gambar 2. Inti Bakteri Bacillus subtilis

Bacillus subtilis termasuk jenis Bacillus. Bacillus subtilis mempunyai kemampuan untuk membentuk endospora yang protektif yang memberi kemampuan bakteri tersebut mentolerir keadaan yang ekstrim. Tidak seperti species lain seperti sejarah, Bacillus subtilis diklasifikasikan sebagai obligat anaerob walau penelitian sekarang tidak benar. Bacillus subtilis tidak dianggap sebagai patogen walaupun kontaminasi makanan tetapi jarang menyebabkan keracunan makanan. Sporanya dapat tahan terhadap panas tinggi yang sering digunakan pada makanan dan bertanggung jawab terhadap kerusakan pada roti.

Bacillus subtilis selnya berbentuk basil, ada yang tebal dan yang tipis. Biasanya bentuk rantai atau terpisah. Sebagian motil dan adapula yang non motil. Semua membentuk endospora yang berbentuk bulat dan oval.  Baccillus subtlis merupakan jenis kelompok bakteri termofilik yang dapat tumbuh pada kisaran suhu 45 °C – 55 °C dan mempunyai pertumbuhan suhu optimum pada suhu 60 °C – 80 °.

Bacilus Subtilis ini awalnya bernama Vibro subtilis oleh Christian Gottfried Ehrenberg pada tahun 1835. Kemudian nama bacillus subtilis dikenalkan oleh Ferdinand Cohn pada 1872. B. subtilis telah digunakan sepanjang 1950 sebagai alternatif dari obat karena efek immunostimulatory sel dari masalah, yang pada pencernaan telah ditemukan secara signifikan untuk kekebalan aktivasi antibodi spesifik GM, IgG ,dan Iga keluarnya. Bakteri ini dipasarkan di seluruh Amerika dan Eropa dari 1946 sebagai immunostimulatory bantuan dalam usus dan perawatan dari penyakit urinary tract seperti Rotavirus dan Shigella, tetapi ditolak popularitasnya setelah pengenalan konsumen antibiotik murah walaupun kurang menyebabkan reaksi alergi kesempatan yang cukup rendah dan racun normal flora usus. 

B. subtilis tidak dianggap sebagai manusia pathogen; dapat mencemari makanan tetapi jarang menyebabkan keracunan makanan. B. subtilis produces the proteolytic enzyme subtilisin . B. subtilis menghasilkan enzim proteolytic yang subtilisin. B. subtilis spores dapat hidup yang ekstrim pemanasan yang sering digunakan untuk memasak makanan, dan bertanggung jawab untuk menyebabkan kekentalan yang lengket, membenang konsistensi yang disebabkan oleh bakteri produksi panjang rantai polysaccharides dan manja dalam adonan roti.

B. subtilis dapat membagi asymmetrically, memproduksi sebuah endospore yang tahan terhadap faktor lingkungan seperti panas, asam, dan garam, yang dapat berada di dalam lingkungan dalam jangka waktu yang lama. Endospore adalah yang dibentuk pada saat gizi stres, memungkinkan organisme untuk terus berada di dalam lingkungan sampai kondisi menjadi baik. Sebelum proses untuk menghasilkan spora bakteri melalui proses produksi flagella dan mengambil DNA dari lingkungan.

B. subtilis terbukti untuk manipulasi genetik, karena itu telah menjadi banyak diadopsi sebagai model organisme untuk penelitian laboratorium, terutama dari sporulation, yang merupakan contoh sederhana dari diferensiasi selular. Hal ini juga sangat flagellated, yang memberikan B. subtilis kemampuan untuk bergerak sangat cepat.

B. subtilis memiliki sekitar 4.100 gen. Dari jumlah tersebut, hanya 192 yang ditampilkan. Mayoritas gen yang penting dalam kategori domain relatif sedikit dari metabolisme sel, dengan sekitar separuh yang terlibat dalam pengolahan informasi, satu-kelima yang terlibat dalam sintesis dari sel amplop dan penentuan bentuk dan divisi sel, dan satu-kesepuluh yang berkaitan dengan sel energetika.

Aplikasi bakteri ini dalam industry cukup banyak. Bacillus subtilis merupakan salah satu yang paling banyak digunakan untuk produksi enzymes dan bahan kimia khusus. Aplikasi industri termasuk produksi amylase, protease, inosine, ribosides, dan asam amino. Selain itu, aplikasinya banyak sekali. Enzymes diproduksi oleh B. subtilis dan B.licheniformis secara luas digunakan sebagai tambahan dalam laundry deterjen. Kemudian bakteri ini dapat memainkan peran dalam pengamanan limbah radionuclide [misalnya Thorium (IV) dan Plutonium (IV)] pembuangan dengan mengikat proton properti dari permukaan.

Kegunaan lain bakteri ini cukup banyak sekarang dangan berkembangnya teknologi. B. subtilis strain QST 713 (dipasarkan sebagai QST 713 atau serenade) memiliki alam berhubung dgn fungisida aktivitas, dan bekerja sebagai agen kontrol biologi. populer di seluruh dunia sebelum pengenalan konsumen antibiotik immunostimulatory sebagai agen untuk membantu perawatan gastrointestinal dan penyakit urinary tract. Hal ini masih banyak digunakan di Eropa Barat dan Timur Tengah sebagai alternatif obat. dapat dikonversi menjadi peledak berbahaya compounds dari nitrogen, karbon dioksida, dan air. recombinants B. subtilis str. pBE2C1 dan B. subtilis str. pBE2C1AB digunakan dalam produksi polyhydroxyalkanoates (PHA) dan agar mereka dapat menggunakan gandum terendam air limbah sebagai sumber karbon untuk menurunkan biaya produksi PHA. 

Referensi:
Anonim. http://www.wikipedia.org/wiki/Bacillus_subtilis.
Kastanya, Yongki. http://yongkikastanyaluthana.wordpress.com/2008/11/22/4141. 

Read More

Belajar Github : Membuat Branch terhadap sebuah Project (Repositori)

Ini adalah catatan tentang belajar Github bersama Sugeng Hariyanto dan Wahyu Madya Pratama dan Pratiwi Indah Sari.

Postingan ini saya khususkan untuk mensharingkan pembuatan Branch dari suatu master Project di Github:
1. Pastikan komputer anda sudah terinstal software Github for Windows atau teman-temannya. kalau belum ada dan belum punya masternya silakan download disini master Github
2. Jika sudah terinstal. Buka aplikasi dan lakukan konfigurasi terhadap software Github yang sudah terinstal. berikut ini adalah beberapa langkah yang perlu dilakukan:

• Cek apakah Github yang ada di komputer kita sudah terkoneksi dengan Github yang online, dengan cara mengetikkan perintah $ssh -T git@github.com
• Jika menghasilkan 'permission denied' maka ketikkan perintah untuk membuat keygen (kunci masuk) dengan megetikan perintah $ssh-keygen -t rsa -C "email@email.com". Enter. Enter. Enter. Enter. (NB: email@email.com adalah akun email yang anda digunakan untuk membuat akun Github
• Setelah itu akan terbentuk sebuah file kunci. Kita dapat mengeceknya di C:/Users/namaUser/.ssh/id_rsa.pub.
• Buka file id_rsa.pub menggunakan notepas dan copy semua isinya.
• Masuk di akun github anda. Pada pojok kanan atas pilih icon Account Setting --> pilih SSH Keys --> add SSH Keys --> paste isi dari id_rsa.pub.
• Konfirmasi
• Cek lagi keterhubungan github (repositori) lokal dengan repositori pada akun github anda dengan perintah yang sama pada langkah pertama
• Lakukan konfigurasi username, password dan email, dengan cara mengetikkan perintah:

$git config --global github.user "username_anda" [enter]
$git config --global user.name "username_anda" [enter]
$git config --global user.email "email_anda" [enter]

3. Langkah untuk membuat Branch

• Carilah akun project leader anda menggunakan  fasilitas search yang telah disediakan github
• Masuk ke project yang sedang anda kerjakan bersama
• Klik tombol "Fork". maka secara otomatis akan terdapat project yang sama pada akun github anda
• untuk file yang dapat diedit melalui github (seperti txt), anda dapat menggunakan langkah berikut:

1. klik file yang akan diedit
2. klik tombol Edit
3. tulis perubahannya
4. simpan
5. Pull request (untuk mengirimkan fileyang anda ubah ke project leader anda)

• Proses "Fork" juga dapat dilakukan dari software github yang ada pada komputer lokal dengan cara:

1. masuk ke project yang akan di clone
2. klik tombol SSH -> copy link ssh
3. pada software github ketikkan $git clone git@github.com: [pastekan link ssh tadi]
4. tekan enter
5. setelah itu pada folder tempat keygen terbentuk akan secara otomatis tercipta file / folder bernama nama project anda yang isinya sama dengan isi pada project di repositori online.
6. namun, lakukan penghapusan pada folder .git.
7. ketikan perintah $cd nama_project
8. ketikan perintah $git init (untuk membuat .git anda sendiri)
9. ketikkan perintah $git remote add origin git@github.com: [pastekan ssh hasil fork]

4. Untuk mengupload/menambahkan sebuah file:

• Copy file yang akan diupload ke folder tempat repositori lokal  berada
• ketikkan perintah $git add * (untuk mengupload kembali semua file yang ada pada project)
• ketikkan perintah $git commit -m "komentar anda"
• $git push

sekian notulen belajar bersama Github

Read More

ANALISIS

Aplikasi A-Dictionary

By : Pramesthi Handaru

100533404331

 Melanjutkan hasil analisi yang telah saya upload kemari.Saya melakukan beberapa penyempurnaan.

Analisis A-Dictionary memiliki beberapa point, yaitu :

1. Analisi Kebutuhan

 a. Kebutuhan Fungsional

 b. Non-Fungsional

Isinya sama seperti analisis sebelumnya

2. Analisis Sistem

·         Pencarian hewan

Tampilan awal dari aplikasi A-Dictionary for Chird berupa menu-menu dan terdapat fungsi pencarian di atasnya. Pengguna memasukkan kata kunci (nama hewan) lalu klik tombol pencarian maka akan tampil hasil pencarain yang sesuai. Selanjutnya pengguna memilih hasil pencarian yang cocok maka akan muncul tampilan hewan yang dipilih.

·         Penampilan fitur pada hewan

Setelah tampil satu animasi hewan maka akan muncul animasi yang menggambarkan perilaku hewan tersebut. Aplikasi ini akan mengeluarkan cara pengucapan nama hewan tersebut dalam bahasa indonesia dan bahasa Inggris. Animasi hewan akan bergerak menunjukkan cara hidup dan habitat mereka. Animasi hewan ini juga akan memunculkan suara dari hewan tersebut.

3. Jalannya Sistem

menjelaskan bagaimana sistem berjalan

4. Pemodelan DFD

berisi :

- Context Diagram

- DFD level 1

- USe-Case Diagram'

- Activity Diagram

5. Analisis Kelayakan Sistem

1.      Kelayakan Teknis

2. KElayakan Ekonomi

3. KElayakan Operasional

4. Kelayakan Strategik

6. Software yang digunakan

 - Bahasa pemrograman web (html,css,js)

- Database : SQLite

- PhoneGap

- Macromedia Flash

- Photoshop

7.  Ask “context-free” questions

Berisi pertanyaan dan jawaban dari isi aplikasi yang akan dibuat

8.  Analisis User

berisi tentang analisi pengguna aplikasi A-Dictionary

Untuk lebih jelasnya tentang ANALISIS APLIKASI silahkan download di sini

atau http://www.mediafire.com/file/cn9n710l38d1zan/ANALISI_A-Dictionary_Part-2_by_Pramesthi_Handaru.docx

Read More